BioInfoServ OS 1.0

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BioInfoServ OS 1.0  Mannual

由于本系统是基于hiweed-linux系统定制的，手册基于hiweed-linux Desktop 1.0 FAQ编写。关于BioInfoServ OS更多使用细节，可查看本地站点， 或者查看互联网站点：http://www.bioinfoserv.org 或 http://bioinfoserv.vicp.net
Windows系统与BioInfoServ OS系统软件对应列表

　
  1. 办公软件
  2. 文献管理
  3. 文档阅读
  4. 文件管理
  5. 语言词典
  6. 图片工具
  7. 媒体工具
  8. 光盘工具
  9. 网络工具
  10. 下载工具
  11. 开发工具
  12. 磁盘工具
  13. 三维桌面
  14. 虚拟模拟
  15. 运行环境
  16. 系统管理
  17. 压缩工具
  18. 系统安全
  19. 游戏软件
  20. 站点服务
  21. 数据库
  22. 行业软件

  23. 生物软件

    序列编辑
    序列分析

　 

说明：本列表中的软件，BioInfoServ OS只精选一部分来安装（红色部分），其余未能安装的，如有需要，请自行安装。本表不对各软件功能进行评价，因为功能根据需求而定。
       本列表同样使用windows系统和其他Linux系统的软件对应。

1. 办公软件

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
Word, PPT, Excle,公式 Microsoft Office openoffice.org, EioOffice, Goolge Doc
笔记 Microsoft Office OneNote Notecase, BasKet NotePads,
桌面wiki 　 Zim desktop wiki,Newton

排版

Adobe PageMaker

Scribus

编辑器

Ultraedit

vim，Gedit
个人信息 rainlendarfor windows，Personal Planner rainlendar，Pimlico,gLabels

2. 文献管理

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
文献管理 ReferenceManager, EndNote Bibus,JabRef,KBibTeX,BibTool,Referencer

密码管理

My Password Manager

Revelation,

3. 文档阅读

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
PDF阅读 Adobe acrobat reader，Foxit adobe acrobat reader for linux,Foxit，Evince,Xpdf,ePDFView, KPDF

PDF打印

PDFCreator，Adobe acrobat reader professional 6.0

openoffice.org，PDFCreator
中国期刊网 CAJViewer -
维普 vipbrowser -
书生之家 书生阅读器 -

帮助文件

chmReader2003

Chmsee,CHM Reader

4 文件管理

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
文件管理器 Exproler(系统自带），TotalCommand

thunar,Krusader
桌面搜索 GoogleDesktop beagle，searchMonkey，gpycds
文件比较 beyond Compare meld,KDiff3
文件目录树 JR Directory Printer Utility，Directory Printer baobad
文件命名 Batch Rename bulk rename
文件备份 　 Unison

5 语言词典

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
字典、词典 Kinsoft xdict,Zhongwen，Clavisinica,babylon stardict，dictd，hanzim
单词记忆 轻轻松松背单词 reciteword

6.图片工具

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
Mind mapping FreeMind for windows FreeMind，xfig
Draw diagrams Dia for windows，Microfot Visio Dia，Kivio
图片查看 ACDSee Gqview，gthumb
图片编辑 PhotoShop gimp
图片管理 Adobe PhotoAlbum，picasa picasa for linux, f-spot，digiKam
屏幕抓图 SnapShot Ksnapshot

颜色拾取

ColorSpy

gcolor2

7. 媒体工具

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
音乐影视播放 footbar 2000，windows media player, Realplayer, windDVD 6, Media player Classic，Microsoft Windows Media Center beep，Amarok，Audacious，vlc，mplayer，totem，realplayer for linux，MythTV,freevo
网络电视 pplive, sopcast
视频录像 CamtasiaStudio，Flash Cam， dvt-qt,Istanbul Desktop Session recorder，tvtime
媒体编辑

moviesmaker，Aurora Media Workshop

PiTiVi
格式转换 　 　

8. 光盘工具

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
光盘刻录 Nero Burning ROM GnomeBaker,K3b,Nerolinux
光盘加载 Daemon Tools GmoutISO(简易脚本） ，AcetoneISO
光盘ISO编辑 UltraISO isomaster
DVD/CD提取 streamboxripper，DVDShrink Ripperx，K9Copy

9. 网络工具

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
浏览器 Internet Explorer, firefox for windows,Mozilla web brower for windows,opera for windows firefox,Mozilla web brower,opera,lynx
离线浏览器 webZip webTTrack,gwget,grsync
拨号器 星空互联 dsl/pppoE
邮件客户端 Microsoft Outlook,Foxmail Sylpheed claws
聊天工具 Tecent QQ, MSN, GoogleTalk,skype，mIRC，NetMeeting Amsn,eva,Lumaqq,Gaim,Kopete,Topioca,xchat IRC,Wengo Phone,skype，Ekiga

10. 下载工具

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
多线程下载 flashGet dowloader for x,Multiget,Prozgui
FTP下载 CuteFTP Gftp,FileZilla，FireFTP，CrossFTP
点对点下载 emule, mldonkey,azureus Amule,azureus,mldonkey
流媒体下载 StreamBox，Net Transport 直接采用命令：mplayer url -dumpstream -dumpfile theSaveName

11. 开发工具

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
集成开发 VisualASM，Komodo IDE，PHPEd，Zend Studio Eclipse，Komodo IDE
网页编辑 Microsoft Frontpage，Dream weaver，firework nvu，Bluefish，Emacs
XML编写 xmlBlueprint XML Editor Mozilla Composer
CSS编写 Rapid CSS cssed Editor
界面设计 powerbuilder Glade Interface designer,Gazpacho Interface designer
数据库开发 Orcle SQL Developer 　
正则表达式 　 ^txt2regex$

12. 磁盘工具

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
分区工具 PartionMagic parted,disks-admin
磁盘修复 MHDD mondo
磁盘镜像 Norton ghost clonezilla
数据恢复 EasyRecovery testdisk，PhotoRec，BakBone Software

13. 三维桌面

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
三维桌面 SphereXP,lg3d beryl/compiz+xgl,lg3d

14. 虚拟模拟

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
系统虚拟机 Vmware，Virtual PC Vmware player,virtual box
跨平台移植 - Easy wine, Crossover Office, Hiweedlayer，Cedega

15. 运行环境

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
Java运行环境 j2re,j2sdk j2re,j2sdk
Python运行环境 python python
perl运行环境 perl perl
php运行环境 php php
ruby运行环境 ruby ruby
c语言环境 WIN-TC Tiny C

16. 系统管理

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
硬/软件测试 Everest hardinfo,
启动配置 msconfig（系统自带） sysv-rc-conf,bootup-manager，xubuntu-services
设备管理 系统自带 hal-device-manager
系统驱动配置器 - xorg-editor , x.org setrp
注册表 regedit（系统自带） gconf
字体管理 Font Print Magic dfontgr
系统清理 TuneUp Utilities，EasyCleaner，regclean Kleansweep
软件包管理 系统自带 getdep,revome orphone packages，synaptic,apt
程序关联 - Alternatives administrator
系统美化 TuneUp Utilities，Talisman，Atmosphere Deluxe gnome-art
输入法 GooglePinyin，wubi scim
Doker objectdock Kx-docker
系统光盘制作 　

reconstructor, uck
启动菜单管理 　 StartUp Manager

 17. 压缩工具

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
压缩工具 winrar,winzip xarchiver, file-roller,PeaZip

 18.系统安全

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
杀毒软件 kaspersky antivirus Avast!
防火墙 kaspersky firewall FireStar
SSH登录 putty SSH client
远程桌面 mstsc(系统自带） redesktop

19. 游戏软件

功能 windows系统 BioInfoServOS系统

极速飙车

 VDrift
　 　 　

游戏对本系统而言不是很重要的，仅仅列举几个。如果您需要运行其他相关游戏，请以关键词“game”搜索软件仓库后，进行安装。而且采用easyWine和Cedega可以很好地将windows下的游戏软件进行快捷移植，其游戏的流畅性丝毫不必windows下运行差。

20. 站点服务

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
web服务器 IIS Apache
FTP服务器 Serv-U Gproftp
内容管理 xoops,Mambo xoops,Mambo
整站服务 Lamp for windows,FoxServ XAMMP, Lamp

21. 数据库

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
数据库 Microsoft SQL Server，Oracle for windows Mysql,Postgresql,Oracle for linux
数据库管理工具 SQL Explorer2000 Myql administartor,PHPMyadmin，eclipsesql

20. 行业软件

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
三维建模 3D Studio Max，AotoCAD K-3D, Wings 3D,Art of Illusion ,Blender

注：行业软件实在太多，本单元列表，只简单列举几个。

22. 生物软件

这个列表还在编写中，争取5.1期间完成。

功能 windows系统 BioInfoServOS系统
统计计算 SPSS，SAS SciLab,Web Mathematics，octave，R，Maxima
序列编辑 BioEdit，Sequence Manipulation Suite Sequence Manipulation Suite
序列分析 Staden for windows,Jemboss for windows staden,jemboss
结果显示 seaview for windows,GeneDoc seaview
基因设计 　 　
基因组可视化 　 　
引物设计 Primer Premier perl primer,primer3
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　
　 　 　

　

BioInfoServ Desktop OS 1.0